Государственный научно-исследовательский институт операционных систем, номинирован как Национальная контактная точка по тематическому приоритету «Информационные и коммуникационные технологии» 7 Рамочной программы ЕС по двум проектам: ERANIS и IDEAL-IST.

Также институт ведет активные работы над улучшением программных продуктов с открытым исходным кодом. Открытое ПО помогает компаниям сэкономить деньги, более безопасно и в некоторых случаях работает лучше, чем лицензионное программное обеспечение. Однако, использующие его организации не лишены определенных проблем. Наиболее распространенная из них — это возможная несовместимость его с лицензионным ПО, которое поставляется в комплекте с оборудованием, а также, как следствие, возникновение системных сбоев. Последнее особенно актуально для фирм, занимающихся аутсорсингом и корпоративными решениями. Проекты проводимые ФГУП ГосНИИ ОС имеют своей целью повышение уровня совместимости коммерческого ПО с открытыми ОС.

Проект ERANIS (Strengthening co-operation between European Research Area and New Independent States)– развитие международного научно-технического сотрудничества ЕС-Россия, интеграция ученых и научных коллективов Новых Независимых Государств (Россия, Беларусь, Украина, Молдова), сокращенно NIS, в Европейское научной пространство, сокращенно ERA. Проект ERANIS поддержан Еврокомиссией и финансируется за счет бюджета 6 Рамочной программы ЕС, срок действия которой закончился в декабре 2006. Новый этап проекта ERANIS стартовал 1 января 2007 года и продлится до 31 декабря 2008 (продолжительность проекта – 2 года).

Проект Ideal-ist - глобальная сеть поиска партнеров для участия в международных европейских проектах в рамках тематического приоритета "Информационные и коммуникационные технологии" 7 Рамочной программы Евросоюза. Проект был поддержан Еврокомиссией, продолжительность проекта - 2 года (октябрь 2006 - сентябрь 2008). В состав международного консорциума проекта вошло около 50 партнеров из стран-членов Евросоюза, Ассоциированных стран, а также третьих стран, к которым относится и Россия.

Проектом предполагается модификация дистрибутива операционной системы семейства Linux под нужды крупных российских промышленных предприятий, в том числе и энергетического сектора.

Проект SWAT является проектом с открытым исходным кодом и предполагает работы по усовершенствованию подсистемы удаленного администрирования операциных систем семейства Linux.